More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2466 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_2138  hypothetical protein  93.13 
 
 
524 aa  1013    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0103709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2466  Fmu (Sun)  100 
 
 
524 aa  1082    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.483409  normal  0.190397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2382  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.73 
 
 
528 aa  590  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.029605 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.43 
 
 
462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  35.94 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  34.8 
 
 
436 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  32.33 
 
 
451 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.34 
 
 
427 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  33.81 
 
 
429 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  32.73 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  32.73 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  32.73 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  32.73 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  32.73 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  32.93 
 
 
429 aa  233  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.13 
 
 
429 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  34 
 
 
440 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  32.93 
 
 
429 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  32.79 
 
 
433 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  32.93 
 
 
429 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  32.93 
 
 
429 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  32.69 
 
 
462 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.86 
 
 
444 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  32.93 
 
 
429 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  34.41 
 
 
436 aa  230  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.73 
 
 
429 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  31.64 
 
 
445 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  32.53 
 
 
429 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  32.73 
 
 
429 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.47 
 
 
427 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  33.67 
 
 
428 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  33.67 
 
 
428 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  33.47 
 
 
428 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  33.67 
 
 
428 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  32.5 
 
 
435 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  32.79 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  32.79 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  33.6 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.52 
 
 
428 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  32.15 
 
 
443 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  33.2 
 
 
427 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  32.65 
 
 
425 aa  217  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0197  sun protein  34.34 
 
 
432 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  34.13 
 
 
434 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  30.78 
 
 
431 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  33.81 
 
 
437 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  31.71 
 
 
431 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.06 
 
 
434 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  33.2 
 
 
434 aa  213  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  32.59 
 
 
429 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  32.04 
 
 
428 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  31.66 
 
 
429 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  33.27 
 
 
429 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  31.84 
 
 
426 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  32.24 
 
 
426 aa  209  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  32.62 
 
 
433 aa  209  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  32.26 
 
 
427 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  33.2 
 
 
428 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  31.32 
 
 
429 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.87 
 
 
427 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  30.56 
 
 
429 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  32.17 
 
 
427 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  30.56 
 
 
431 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  32.24 
 
 
429 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  31.95 
 
 
427 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  35.15 
 
 
436 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  34.69 
 
 
436 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  34.24 
 
 
436 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  33.06 
 
 
448 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  34.69 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3894  sun protein  32.55 
 
 
457 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3243  sun protein  32.3 
 
 
457 aa  200  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.62 
 
 
436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.28 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  32.45 
 
 
439 aa  196  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0017  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33 
 
 
448 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0392  sun protein  31.51 
 
 
442 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  30.71 
 
 
430 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2266  sun protein  33.33 
 
 
470 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.71 
 
 
430 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.79 
 
 
443 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.49 
 
 
403 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  30.68 
 
 
437 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0513  sun protein  31.04 
 
 
462 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.426723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0184  sun protein  30.36 
 
 
425 aa  186  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3590  sun protein  35.39 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0840523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  29.75 
 
 
429 aa  183  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3632  sun protein  31.66 
 
 
450 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.10429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  29.9 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  29.9 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4528  sun protein  30.47 
 
 
461 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2077  sun protein  30.26 
 
 
438 aa  180  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  30.43 
 
 
437 aa  179  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  32.25 
 
 
457 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.38 
 
 
457 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4436  sun protein  31.74 
 
 
445 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.17 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  31.75 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0028  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.33 
 
 
419 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4003  sun protein  31.21 
 
 
453 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000045232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>