More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2138 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1082    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0103709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2466  Fmu (Sun)  93.13 
 
 		 524 aa  1013    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.483409  normal  0.190397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2382  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.54 
 
 		 528 aa  591  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029605 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.99 
 
 		 462 aa  256  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  36.35 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  33.74 
 
 		 429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  33.54 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.54 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  35.4 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  33.54 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33.54 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  34.34 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33.54 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  33.74 
 
 		 429 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.14 
 
 		 429 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  34.47 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 429 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.94 
 
 		 429 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.94 
 
 		 429 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  33.74 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  33.74 
 
 		 429 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  33.81 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.47 
 
 		 427 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  33.27 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  34.74 
 
 		 436 aa  231  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  31.64 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  32.11 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  33.33 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  33.67 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  33.67 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  32.73 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  32.69 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  33.67 
 
 		 428 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  33.47 
 
 		 428 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  33 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  33 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.06 
 
 		 444 aa  226  9e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  32.53 
 
 		 428 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  33.4 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  33.14 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 431 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  31.79 
 
 		 431 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  32.86 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  33.8 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  35.29 
 
 		 437 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  33.88 
 
 		 425 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  32.1 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0197  sun protein  35.15 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  32.59 
 
 		 429 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  32.65 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  32.24 
 
 		 429 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  33.81 
 
 		 427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.73 
 
 		 434 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  33.07 
 
 		 427 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  31.72 
 
 		 426 aa  213  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  33.01 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  32.24 
 
 		 429 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  31.84 
 
 		 426 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  31.77 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  32.45 
 
 		 428 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  32.17 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  35.52 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  32.17 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  35.07 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  33.27 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  34.62 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  33.01 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  31.35 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  31.35 
 
 		 429 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  35.07 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.89 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3243  sun protein  32.48 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3894  sun protein  32.41 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0017  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.2 
 
 		 448 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.29 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  30.57 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.35 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2266  sun protein  33.53 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  32.25 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0392  sun protein  32.09 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.57 
 
 		 430 aa  196  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  31.4 
 
 		 437 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.49 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0513  sun protein  33.2 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426723 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  31.29 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  31.29 
 
 		 431 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0184  sun protein  30.36 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  30.53 
 
 		 429 aa  187  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  31.03 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2077  sun protein  30.46 
 
 		 438 aa  182  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3590  sun protein  33.49 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0840523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  32.7 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.98 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  31.75 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3632  sun protein  29.74 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.10429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4436  sun protein  31 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.59 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0028  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4528  sun protein  29.06 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4003  sun protein  30.73 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000045232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>