247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0376 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0376  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
359 aa  720    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635949  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
550 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
426 aa  63.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
432 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  43.84 
 
 
414 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  42.42 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  39.06 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
404 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.08 
 
 
396 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 
427 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  25.65 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  38.03 
 
 
598 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  43.28 
 
 
410 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  39.19 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
400 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
398 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
412 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
409 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.53 
 
 
388 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  30.99 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
417 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  33 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
366 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.03 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  27 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  40.85 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
419 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28 
 
 
404 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
384 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 
405 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
411 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
398 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  29.58 
 
 
371 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
467 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
376 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
421 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
535 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.12 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.39 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.65 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  24.6 
 
 
468 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  46.03 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.9 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.42 
 
 
424 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  24.05 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  24.49 
 
 
423 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.77 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
423 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>