More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4282 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4282  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 
399 aa  832    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06180  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  36.29 
 
 
377 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0160226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00986  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  36.29 
 
 
377 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0610  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.48 
 
 
381 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2646  Rieske (2Fe-2S) region  31.3 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.484133  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3035  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.62 
 
 
382 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.416925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2807  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.62 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3114  Rieske (2Fe-2S) region  33 
 
 
367 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
369 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.04 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.58 
 
 
430 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  32.52 
 
 
429 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  32.52 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
430 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.58 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
430 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  30.58 
 
 
430 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  31.6 
 
 
432 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 
430 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  31.6 
 
 
410 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  31.55 
 
 
445 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1801  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.91 
 
 
401 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195025  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6040  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 
382 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0685009  hitchhiker  0.0092314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.92 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.63 
 
 
492 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.575491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  26.01 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2370  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.5 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1761  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.04 
 
 
470 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001292  phenylpropionate dioxygenase and related ring-hydroxylating dioxygenases large terminal subunit  30.48 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.99509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3246  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit:Rieske (2Fe-2S) region  26.49 
 
 
456 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178778  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.72 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  23.82 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.78 
 
 
380 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
392 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
413 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  27.78 
 
 
387 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  27.45 
 
 
414 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.86 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13182  dioxygenase  30.92 
 
 
382 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000395149  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.96 
 
 
358 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.82 
 
 
448 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.05 
 
 
447 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  30.15 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.4 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.52 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.15 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1531  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.37 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0185016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  27.27 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.15 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.19 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.28 
 
 
440 aa  90.1  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.15 
 
 
427 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  28.22 
 
 
374 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  26.56 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.77 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3468  putative iron-sulphur Rieske protein  27.5 
 
 
387 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.39757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.88 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1502  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.29 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.409233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6914  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.86 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3276  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.86 
 
 
436 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.82 
 
 
427 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1468  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.07 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  26.6 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  24.43 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0159  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.64 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.18 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.88 
 
 
443 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.15 
 
 
382 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42190  aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  23.6 
 
 
448 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0579776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.36 
 
 
383 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.64 
 
 
384 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  26.93 
 
 
444 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.58 
 
 
369 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5836  Rieske (2Fe-2S) region  30.65 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1831  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 
374 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.15 
 
 
429 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  27.23 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  28.28 
 
 
376 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  28.95 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2770  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0200185  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.5 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  28.95 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1782  putative ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  30.9 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3840  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  25.82 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  22.79 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  28.72 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3962  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.41 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2719  benzoate 1,2-dioxygenase large subunit  29.95 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>