40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8918 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8918  predicted protein  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38586  predicted protein  38.12 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.03 
 
 		 1652 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  23.87 
 
 		 489 aa  51.6  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  37.14 
 
 		 459 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  29.66 
 
 		 466 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42847  predicted protein  34.51 
 
 		 984 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.451507  normal  0.305439 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35336  predicted protein  27.84 
 
 		 486 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 		 1190 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  22.49 
 
 		 432 aa  48.5  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  32.32 
 
 		 484 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39580  predicted protein  26.71 
 
 		 376 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.94 
 
 		 664 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 		 1208 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58162  predicted protein  29.79 
 
 		 656 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0479106  normal  0.311392 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29180  predicted protein  31.11 
 
 		 505 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.648326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 		 1617 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1477 aa  44.7  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 1188 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.18 
 
 		 1242 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.55 
 
 		 1163 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04980  peroxisome targeting signal receptor, putative  23.37 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0414188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1789 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_006686  CND01460  vacuolar membrane protein, putative  28.99 
 
 		 1073 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1858 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 		 1164 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 		 865 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  27.35 
 
 		 521 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.32 
 
 		 1357 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26618  predicted protein  28.92 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.955869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1152 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47010  predicted protein  32.47 
 
 		 1133 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.671968  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 		 523 aa  42  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.42 
 
 		 344 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  28.92 
 
 		 402 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.12 
 
 		 716 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.69 
 
 		 1217 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  27.87 
 
 		 535 aa  41.2  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11703  predicted protein  32.89 
 
 		 820 aa  41.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  25 
 
 		 355 aa  41.2  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>