55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58162 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_58162  predicted protein  100 
 
 		 656 aa  1353    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0479106  normal  0.311392 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00305  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Dip2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02680)  30.77 
 
 		 963 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140894  normal  0.864535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  40.58 
 
 		 1831 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  37.14 
 
 		 551 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  38.57 
 
 		 592 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.76845 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06867  Mitochondrial division protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXW3]  28.7 
 
 		 654 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  0.183492 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30256  beta transducin  33.33 
 
 		 977 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.1 
 
 		 1858 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.7 
 
 		 664 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.07 
 
 		 1164 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.52 
 
 		 806 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.85 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01130  ribosome biogenesis-related protein, putative  32.86 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0346843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1196 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81799  substrate-specific activator of APC-dependent proteolysis  35 
 
 		 592 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0740559  normal  0.327492 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29147  predicted protein  35.29 
 
 		 438 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07205  ribosome biogenesis protein (Rrb1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10320)  32.39 
 
 		 492 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 		 695 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 898 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  34.33 
 
 		 473 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  34.43 
 
 		 452 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  39.34 
 
 		 742 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.85 
 
 		 1901 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  32.88 
 
 		 367 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.02 
 
 		 924 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  32.99 
 
 		 762 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08701  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02410)  33.91 
 
 		 1462 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  28.74 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.53 
 
 		 1280 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47119  nucleotide-binding protein  22.48 
 
 		 459 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  29.23 
 
 		 520 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  35.21 
 
 		 407 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.91 
 
 		 1652 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.31 
 
 		 716 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8918  predicted protein  29.79 
 
 		 190 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  31.88 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02070  trp-asp repeats containing protein, putative  28.57 
 
 		 757 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08187  kinetochore protein (Eurofung)  34.72 
 
 		 411 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.99 
 
 		 1217 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.52 
 
 		 682 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.67 
 
 		 1004 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  34.52 
 
 		 947 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31740  predicted protein  27.18 
 
 		 458 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00065  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12370)  30.39 
 
 		 364 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371171 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  29.35 
 
 		 622 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.18 
 
 		 1363 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31385  predicted protein  28.3 
 
 		 462 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000357166  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00081  G-protein beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74214]  28.85 
 
 		 352 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26671  predicted protein  23.31 
 
 		 432 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.976265  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  31.88 
 
 		 1289 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  36.92 
 
 		 694 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  28.26 
 
 		 535 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 1213 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  24.26 
 
 		 1344 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.82 
 
 		 676 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>