More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7666 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_7666  predicted protein  100 
 
 		 130 aa  273  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9083  predicted protein  46.88 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  45.74 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  46.51 
 
 		 164 aa  116  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  43.41 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  43.41 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  44.19 
 
 		 166 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  45.74 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  44.96 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  44.96 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  43.28 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  43.41 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  45.53 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  42.54 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  41.86 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  40 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  40.77 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  41.09 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  41.48 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  41.54 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  47.66 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  41.86 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  41.86 
 
 		 198 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  40 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  39.53 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.24 
 
 		 333 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  39.69 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  39.69 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  40.31 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  40.77 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  42.19 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  40.77 
 
 		 174 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  40 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  44.09 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  43.41 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  42.97 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  41.54 
 
 		 174 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  41.86 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  37.21 
 
 		 183 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  42.52 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  37.21 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  38.93 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  37.21 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  41.32 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  40.5 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  40 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.62 
 
 		 334 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  41.32 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  40.5 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  37.8 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 177 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  38.1 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  40.94 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  39.53 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  42.28 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45 
 
 		 306 aa  94.4  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  38.58 
 
 		 142 aa  94  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  37.8 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  41.41 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  38.76 
 
 		 155 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  38.76 
 
 		 167 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  39.06 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  41.41 
 
 		 161 aa  93.6  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  37.98 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  40.46 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  38.76 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  38.84 
 
 		 121 aa  93.2  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  37.8 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  39.23 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  40.31 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.06 
 
 		 290 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  38.4 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  34.88 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  40.46 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  37.98 
 
 		 190 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  39.53 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  43.44 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  40.94 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  38.24 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  39.53 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  39.26 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  39.84 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  38.97 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  37.01 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  36.8 
 
 		 189 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  37.21 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  40.46 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  38.76 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  38.76 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  40.16 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  40.31 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.26 
 
 		 351 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  36.43 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2342  methionine-R-sulfoxide reductase  41.27 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>