118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47154 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47154  iron ion binding protein  100 
 
 
639 aa  1326    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0750  hypothetical protein  30.86 
 
 
183 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  36.02 
 
 
249 aa  98.2  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  36.02 
 
 
249 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  36.02 
 
 
249 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  35.48 
 
 
249 aa  94.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  35.07 
 
 
249 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0894  hypothetical protein  29.44 
 
 
295 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414459  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  25.95 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.4 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  23.17 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  25.53 
 
 
351 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  25.28 
 
 
337 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  26.64 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2835  hypothetical protein  29.58 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3356  hypothetical protein  27.31 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
343 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
343 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
343 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  26.33 
 
 
327 aa  66.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  28.91 
 
 
321 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  29.69 
 
 
279 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  25.99 
 
 
321 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  29.69 
 
 
279 aa  64.3  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2572  hypothetical protein  30.13 
 
 
288 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 
279 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 
279 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  29.69 
 
 
279 aa  63.9  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  26.82 
 
 
346 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  26.82 
 
 
346 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  26.82 
 
 
346 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  27.72 
 
 
348 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  26.26 
 
 
312 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  24.14 
 
 
311 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  26.91 
 
 
341 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.46 
 
 
321 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  27.93 
 
 
316 aa  60.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  29.32 
 
 
279 aa  60.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  27.78 
 
 
311 aa  60.1  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  26.07 
 
 
320 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  26.07 
 
 
320 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  24.45 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  27.94 
 
 
352 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.24 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  29.53 
 
 
279 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  32.21 
 
 
279 aa  58.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  24.62 
 
 
319 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  25.82 
 
 
341 aa  57.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  26.35 
 
 
349 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2289  hypothetical protein  27.36 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0294  hypothetical protein  26.2 
 
 
297 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  28.27 
 
 
279 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  25.86 
 
 
343 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  26.03 
 
 
349 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  25.38 
 
 
319 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  23.1 
 
 
320 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  23.55 
 
 
300 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  23.55 
 
 
300 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  32.46 
 
 
279 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  27.08 
 
 
279 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  30.87 
 
 
290 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
279 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  27.86 
 
 
367 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 
279 aa  54.7  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  28.04 
 
 
279 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  26.53 
 
 
279 aa  54.7  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  26.98 
 
 
309 aa  53.9  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  32.48 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  24.32 
 
 
323 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  22.94 
 
 
318 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  23.08 
 
 
352 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  27.21 
 
 
280 aa  51.2  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  26.8 
 
 
323 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  25.86 
 
 
318 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  24.1 
 
 
350 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  40.96 
 
 
337 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  25.79 
 
 
343 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  23.95 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  27.46 
 
 
344 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  26 
 
 
323 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  24.72 
 
 
332 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  28.69 
 
 
311 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  24.91 
 
 
339 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  27.38 
 
 
323 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  24.92 
 
 
356 aa  47.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  32 
 
 
289 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  22.3 
 
 
326 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  22.11 
 
 
318 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00077  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12242)  24.04 
 
 
338 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02390  conserved hypothetical protein  23.64 
 
 
367 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  24.44 
 
 
317 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  39.73 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  37.5 
 
 
348 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  34.09 
 
 
350 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2578  hypothetical protein  25.71 
 
 
308 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197218  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  24.48 
 
 
352 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>