160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2637 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
290 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  85.66 
 
 
279 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  79.93 
 
 
279 aa  484  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  78.14 
 
 
279 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  78.14 
 
 
279 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  78.49 
 
 
279 aa  474  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  77.78 
 
 
279 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  77.06 
 
 
279 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  77.42 
 
 
279 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  77.42 
 
 
279 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  77.42 
 
 
279 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  77.42 
 
 
279 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  77.42 
 
 
279 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  77.78 
 
 
279 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  77.42 
 
 
279 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  76.34 
 
 
279 aa  454  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  72.04 
 
 
279 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  70.97 
 
 
279 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  70.97 
 
 
279 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  69.18 
 
 
279 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  66.91 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  65.11 
 
 
279 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  57.3 
 
 
287 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  47.29 
 
 
289 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  33.77 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 
311 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  33.56 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  34.77 
 
 
323 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  31.45 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  33.77 
 
 
348 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.97 
 
 
318 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  30.79 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  30.85 
 
 
316 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  32.15 
 
 
318 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  31.99 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  29.41 
 
 
340 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  28.26 
 
 
337 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  28.31 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  29.62 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.44 
 
 
337 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  28.15 
 
 
313 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  28.62 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  30.04 
 
 
367 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  26.81 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  30.08 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  43.85 
 
 
346 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  27.72 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.57 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  37.17 
 
 
320 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  28.91 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  28.83 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  28.08 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  28.08 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.08 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  29.1 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  27.86 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  27.64 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  27.02 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  36.19 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  37.5 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  27.52 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  27.52 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  27.52 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.78 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  27.82 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  35.24 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  26.39 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  26.57 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  39.64 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  26.35 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.36 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  26.2 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  27.2 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.86 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  38.1 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  41.28 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  41.28 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.86 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  27.59 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  24.15 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  27.52 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  26.14 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  41.28 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  25.56 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  26.32 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  30.11 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  30.11 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  37.14 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  24.44 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  25.28 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  24.9 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  25.65 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  42.2 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  26.48 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>