158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0531 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  74.46 
 
 		 279 aa  434  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  69.06 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  67.99 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  69.42 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  67.27 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  67.27 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  67.99 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  67.27 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  66.91 
 
 		 279 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  65.47 
 
 		 279 aa  394  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  65.83 
 
 		 279 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  65.83 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  65.83 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  65.83 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  65.47 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  67.27 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  64.75 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  66.19 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  63.31 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  65.11 
 
 		 290 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  65.83 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  56.93 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  45.42 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  33.65 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  32.68 
 
 		 318 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  32.38 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  34.53 
 
 		 318 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  33.67 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  32.48 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  33.87 
 
 		 318 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.44 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  31.49 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  27.95 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  31.54 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  28.12 
 
 		 321 aa  98.6  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  27.41 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  28.15 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  28.85 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  27.66 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  28.46 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 		 330 aa  93.6  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.64 
 
 		 321 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  29.23 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  25.65 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  26.39 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  25.86 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  27.14 
 
 		 334 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  26.59 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  36.36 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  36.36 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  36.36 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.91 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  45.71 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  26.74 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  30.15 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  27.27 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.71 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  44.44 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  26.8 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  28.47 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.97 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  28.69 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  28.02 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  27.59 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  26.72 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  26.85 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  26.59 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  28.63 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  23.74 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  26.16 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  23.28 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  26.04 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  26.79 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  43.69 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  43.69 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  40.54 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  43.69 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  31.87 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  27.65 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  25.45 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  26.52 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  26.42 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.52 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  28.09 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  30 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  24.51 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  25.65 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  26.21 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05542  conserved hypothetical protein  39.77 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0412788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  25.71 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  24.81 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00880  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 		 401 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>