162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0225 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  97.5 
 
 
320 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  100 
 
 
320 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  72.19 
 
 
321 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  71.88 
 
 
321 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  70.62 
 
 
321 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  68.55 
 
 
320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  49.22 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  47.78 
 
 
313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  41.64 
 
 
335 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  41.46 
 
 
327 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  44.73 
 
 
346 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  44.73 
 
 
346 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  44.73 
 
 
346 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  39.29 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  38.2 
 
 
349 aa  232  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  41.05 
 
 
329 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  40.56 
 
 
351 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  39.81 
 
 
329 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  41.18 
 
 
352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.58 
 
 
353 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  36 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  38.1 
 
 
337 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  35.01 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  36.39 
 
 
345 aa  206  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  42.35 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  37.78 
 
 
316 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  37.22 
 
 
341 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  39.52 
 
 
339 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  40.07 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  36.28 
 
 
341 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  39.86 
 
 
317 aa  179  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  42.56 
 
 
346 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  36.33 
 
 
323 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  32.8 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  35.05 
 
 
323 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  34.97 
 
 
356 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.71 
 
 
316 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  34.73 
 
 
323 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  33.54 
 
 
344 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  37.63 
 
 
352 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  37.02 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  37.62 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  32.65 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  36.5 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  34.81 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  36.93 
 
 
352 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  37.8 
 
 
334 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  35.67 
 
 
312 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  29.82 
 
 
350 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  37.28 
 
 
340 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  30.65 
 
 
318 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  35.92 
 
 
346 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  32.62 
 
 
332 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  38.14 
 
 
350 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  36.39 
 
 
348 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  36.59 
 
 
340 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  30.7 
 
 
318 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  38.02 
 
 
355 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  34.74 
 
 
355 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  38.02 
 
 
355 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  33.97 
 
 
309 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  37.83 
 
 
343 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  37.83 
 
 
343 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  36.75 
 
 
367 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  36.68 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  36.68 
 
 
334 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  37.45 
 
 
343 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 
321 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  37.76 
 
 
348 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  29.62 
 
 
320 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  35.91 
 
 
349 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.06 
 
 
347 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  31.33 
 
 
323 aa  143  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 
330 aa  143  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  34.03 
 
 
343 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  35.62 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  36.3 
 
 
343 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  31.66 
 
 
341 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  36.51 
 
 
311 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  37.2 
 
 
343 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  37.26 
 
 
347 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  35.71 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  33.13 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  33.13 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  29.3 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  34.63 
 
 
375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  33.62 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  33.8 
 
 
344 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  34.73 
 
 
326 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  31.83 
 
 
340 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  29.38 
 
 
341 aa  122  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  33.55 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  33.87 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  29.88 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  29.83 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2453  2OG-Fe(II) oxygenase  35.09 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0260647  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45605  predicted protein  25.94 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>