162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1002 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 318 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  58.73 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  57.5 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  56.69 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  54.78 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  55.38 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  47.95 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  48.41 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  46.79 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  46.47 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  45.91 
 
 		 323 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  45.19 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  42.76 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  43.15 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 		 338 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  32.49 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  32.82 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  33.44 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  33.02 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  30.65 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  32.65 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  30.67 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  30.51 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.76 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.61 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.03 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  30 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  33.65 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.65 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  34.59 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.07 
 
 		 280 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  31.19 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  34.01 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  31.05 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  34.63 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  33.87 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.06 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  33.22 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  30.89 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  33.78 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  33.12 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.91 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  30.7 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  32.49 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  32.49 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  33.66 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  32.9 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  32.67 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  32.45 
 
 		 279 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  32.61 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  32.61 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  32.61 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  32.15 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  31.72 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  29.78 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  31.27 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  29.32 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  28.21 
 
 		 341 aa  119  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  34.3 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  32.42 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  29.47 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  29.5 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  30.12 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  31.65 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  28.44 
 
 		 350 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  28.95 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  29.73 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  28.04 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  31.69 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  31.69 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  31.69 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.58 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.72 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  28.39 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  29.66 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  29.24 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  27.33 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  27.95 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  30.82 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  28.96 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>