162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1340 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
343 aa  689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  77.62 
 
 
344 aa  541  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  68.47 
 
 
350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  69.94 
 
 
355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  69.94 
 
 
355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  71.3 
 
 
339 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  62.09 
 
 
340 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  62.42 
 
 
340 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  61.19 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  61.03 
 
 
348 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  62.66 
 
 
326 aa  391  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  58.9 
 
 
334 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  59.08 
 
 
334 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  58.36 
 
 
343 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  54.03 
 
 
352 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  57.1 
 
 
347 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  58.59 
 
 
334 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  58.46 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  51.8 
 
 
352 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  53.07 
 
 
367 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  46.71 
 
 
330 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  48.05 
 
 
330 aa  316  3e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  46.41 
 
 
330 aa  315  5e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  49.7 
 
 
346 aa  298  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  46.15 
 
 
349 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  45.91 
 
 
406 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  46.85 
 
 
343 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  46.85 
 
 
343 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  46.85 
 
 
343 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  47.56 
 
 
335 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  43.53 
 
 
343 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  37.86 
 
 
355 aa  215  9e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  37.05 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  37.5 
 
 
353 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  38.54 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  32.98 
 
 
373 aa  169  9e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  35.69 
 
 
335 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  38.41 
 
 
320 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  36.2 
 
 
321 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  36.53 
 
 
330 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  35.15 
 
 
318 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  36.56 
 
 
321 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  37.87 
 
 
346 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  40.14 
 
 
329 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  36.51 
 
 
327 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.55 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  37.02 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  37.02 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  37.02 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  35.4 
 
 
351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  36.93 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  37.54 
 
 
320 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  51.25 
 
 
281 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.69 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  36.3 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  35.45 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  34.21 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 
326 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  31.97 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  29.3 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  34.62 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  32.3 
 
 
352 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  31.15 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  33.33 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 
317 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  31.8 
 
 
341 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 
318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.75 
 
 
311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  30.77 
 
 
316 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  32.67 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  31.6 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  31.05 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  30.53 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  31.45 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  30.72 
 
 
309 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  33.08 
 
 
306 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.42 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.56 
 
 
337 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 
300 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  29.49 
 
 
321 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  29.38 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  32.22 
 
 
233 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  30.23 
 
 
337 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  31.5 
 
 
323 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
335 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  30.37 
 
 
330 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
319 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  29.21 
 
 
316 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 
338 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 
345 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  29.62 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  34.41 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  30.79 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  34.41 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  34.41 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  29.24 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  29.8 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>