162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3600 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 317 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 317 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 317 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  82.91 
 
 		 319 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  84.86 
 
 		 319 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  33.64 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  34.67 
 
 		 334 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  34.46 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.88 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.04 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  34.01 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  34.35 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  33.99 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  32.6 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.68 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  31.63 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  32.5 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.11 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  30.97 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  31.45 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  33.47 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  32.6 
 
 		 351 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  31.68 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  27.55 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  32.4 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  33.68 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  32.14 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  34.42 
 
 		 346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.11 
 
 		 352 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  32.91 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  30.98 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.71 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.36 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  30.38 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  31.62 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  32.81 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  31.33 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  31.7 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.69 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  32.31 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.46 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  29.41 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  31.82 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  31.49 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  31.69 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  29.02 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  33.11 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  31.02 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  30.62 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  27.3 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.91 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.45 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.64 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  31.71 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  32.47 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  32.47 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  32.03 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  32.47 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.03 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  32.76 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  31.54 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  26.02 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  28.31 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 		 367 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  26.25 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  28.12 
 
 		 323 aa  96.3  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  28.17 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  30.79 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  26.52 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  24.53 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  29.48 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.17 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  29.28 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  27.07 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  27.07 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  26.93 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2453  2OG-Fe(II) oxygenase  31.83 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0260647  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  26.33 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  29.04 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  25.54 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  32.19 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 		 335 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  29.73 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  28.23 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  26.06 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>