161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4054 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 319 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  87.74 
 
 		 319 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  84.86 
 
 		 317 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  84.86 
 
 		 317 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  84.86 
 
 		 317 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  34.69 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  32.72 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  34.47 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  32.09 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.13 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  33.94 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  35.77 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  34.26 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  36.13 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  28.99 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  33.11 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  30.72 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  31.79 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  31.66 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  32.21 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.56 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.55 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  34.24 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  30.82 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  33.74 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  32.32 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  31.29 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  30.09 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  30.06 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  29.36 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  30.92 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  34.23 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  31.97 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  31.51 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  28.26 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.06 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  32.09 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  31.9 
 
 		 352 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  31.97 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.37 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  30.38 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  32.87 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  27.86 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  31.7 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  26.63 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.97 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  26.98 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  31.05 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  29.63 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  33.21 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  28.93 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.21 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  31.34 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  30.77 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  33.21 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  33.21 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  27.27 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.06 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  29.43 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  33.21 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  28.71 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  28.71 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.52 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.56 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.89 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  34.55 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  29.07 
 
 		 349 aa  99  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  30.46 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  26.48 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  31.51 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  27.61 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  32.58 
 
 		 367 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  26.71 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  31.93 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  28.94 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  26.85 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  29.04 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  27.55 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  31.97 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  27.78 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  25.24 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>