163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4042 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
339 aa  691    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  61.82 
 
 
330 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  59.17 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  44.82 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  37.46 
 
 
346 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  37.46 
 
 
346 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  37.46 
 
 
346 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  38.92 
 
 
351 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  39.93 
 
 
335 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  38.14 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  43.11 
 
 
329 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  40.28 
 
 
340 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  39.52 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  40.14 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  42.05 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  39.52 
 
 
320 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  38.1 
 
 
353 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  39.73 
 
 
316 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  33.63 
 
 
320 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  38.49 
 
 
320 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  38.24 
 
 
352 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  38.54 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.76 
 
 
321 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  36.93 
 
 
321 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  38.65 
 
 
352 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  38.65 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  36.71 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  37.01 
 
 
348 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  34.47 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  36.93 
 
 
344 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  37.19 
 
 
349 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  37.93 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  35.76 
 
 
349 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  34.51 
 
 
334 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  35.06 
 
 
337 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  40.21 
 
 
347 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  34.38 
 
 
355 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  36.67 
 
 
355 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  33.8 
 
 
346 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.67 
 
 
355 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  35.79 
 
 
343 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  35.79 
 
 
343 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  34.71 
 
 
339 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  35.79 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  36.82 
 
 
367 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  34.42 
 
 
341 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  34.42 
 
 
341 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 
343 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  35.31 
 
 
334 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
334 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  33.23 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  34.97 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  36.97 
 
 
313 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  34.52 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  34.85 
 
 
344 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  32.98 
 
 
334 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  32.98 
 
 
334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  32.11 
 
 
406 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
326 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  36.27 
 
 
311 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.52 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.43 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.43 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  34.47 
 
 
317 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  33.96 
 
 
323 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  34.01 
 
 
321 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.34 
 
 
337 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  31.65 
 
 
353 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  34.63 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  29.82 
 
 
375 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  34 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.66 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  32.87 
 
 
306 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  28.45 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  33.69 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  29.47 
 
 
318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  31.17 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02622  Isopenicillin N synthetase (EC 1.21.3.1)(Isopenicillin N synthase)(IPNS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05326]  30.77 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  29.89 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30.75 
 
 
335 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 
309 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 
323 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  33.64 
 
 
323 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  30.98 
 
 
327 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04806  1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase  32.17 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.375399  normal  0.36141 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  31.35 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 
311 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  29.53 
 
 
316 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.54 
 
 
318 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  31.74 
 
 
348 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  33.05 
 
 
233 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  28.78 
 
 
300 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  28.78 
 
 
300 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 
330 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>