161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1265 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 356 aa  730    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  58.77 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  36.94 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.12 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  37.92 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  35.38 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  35.37 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  36.76 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  34.57 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  33.53 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.36 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.84 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  32.24 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  31.16 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  35.6 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  30.75 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  33.94 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  34.47 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  35.26 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  30.97 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  34.86 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  32.29 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 		 335 aa  133  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  30.38 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  33.45 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.97 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  30.93 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  36.69 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.05 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  28.27 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  32.64 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  28.62 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  30.21 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  25.98 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  32.4 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  32.4 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  32.4 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  31.79 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  32.12 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  32.13 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  30.88 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.97 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  26.81 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  29.66 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.95 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  25.86 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  31.05 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  30.46 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  27.74 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  30.03 
 
 		 352 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.87 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  28.12 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  25.39 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  30.58 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.38 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  27.66 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  29.57 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  29.25 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  26.28 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  26.63 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45605  predicted protein  29.23 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  29.1 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  27.74 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.66 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  29.08 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  24.1 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  28.92 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  28.9 
 
 		 339 aa  96.3  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  30.74 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.32 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  29.77 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  29.45 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  29.97 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  30.46 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  29.48 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  29.48 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  27.11 
 
 		 564 aa  90.1  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  27.72 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  28.48 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  29.97 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  29.57 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  28.36 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  30.79 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  27.88 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>