161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1602 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
318 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  76.75 
 
 
318 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  60.95 
 
 
320 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  55.38 
 
 
318 aa  362  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  54.75 
 
 
316 aa  350  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  54.46 
 
 
316 aa  338  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  49.04 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  48.58 
 
 
311 aa  276  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  45.82 
 
 
323 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  43.17 
 
 
348 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  43.17 
 
 
311 aa  255  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  43.77 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  46.15 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  46.1 
 
 
311 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  32.29 
 
 
340 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  31.91 
 
 
350 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.87 
 
 
334 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  30.58 
 
 
337 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  31.63 
 
 
327 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  30.79 
 
 
321 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 
323 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.89 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  32.17 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 
323 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  32.68 
 
 
279 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.49 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.9 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  139  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 
289 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  33.01 
 
 
279 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30 
 
 
335 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  31.6 
 
 
279 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.94 
 
 
321 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  29.52 
 
 
320 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  32.18 
 
 
349 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  31.96 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  30.31 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  32.97 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  30.82 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  30.38 
 
 
279 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 
279 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.21 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  29.3 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  31.29 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  29.52 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.89 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.94 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  31.97 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  30.8 
 
 
279 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  31.79 
 
 
344 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  30.94 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  30.24 
 
 
279 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  32.52 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  30.19 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  30.03 
 
 
279 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  30.69 
 
 
351 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 
279 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 
279 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 
279 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 
279 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.58 
 
 
353 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  27.66 
 
 
343 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  34.96 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  30.75 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  30.98 
 
 
316 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  31.14 
 
 
341 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 
346 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  32.32 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  29.12 
 
 
341 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.72 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  33.1 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  31.07 
 
 
346 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  31.07 
 
 
346 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  31.07 
 
 
346 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  28.3 
 
 
340 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  30.42 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.76 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  29.72 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  28.89 
 
 
330 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  29.25 
 
 
352 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  29.37 
 
 
330 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  30.54 
 
 
339 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  27.13 
 
 
338 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  28.48 
 
 
327 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  29.12 
 
 
352 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  30.07 
 
 
339 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  29.08 
 
 
350 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  27.44 
 
 
306 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  29.62 
 
 
338 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  29.63 
 
 
349 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  30.11 
 
 
334 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.58 
 
 
334 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  29.68 
 
 
344 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
330 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  27.34 
 
 
319 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>