160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2185 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  99.28 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  96.42 
 
 		 279 aa  557  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  90.68 
 
 		 279 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  90.32 
 
 		 279 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  90.32 
 
 		 279 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  90.32 
 
 		 279 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  90.32 
 
 		 279 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  83.15 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  83.51 
 
 		 279 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  83.51 
 
 		 279 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  83.51 
 
 		 279 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  82.44 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  78.14 
 
 		 290 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  78.49 
 
 		 279 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  74.91 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  74.19 
 
 		 279 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  70.61 
 
 		 279 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  68.46 
 
 		 279 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  67.27 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  64.75 
 
 		 280 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  58.8 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  45.13 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  35.79 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  34.2 
 
 		 317 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.39 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  32.19 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  34.69 
 
 		 348 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  31.58 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  31.13 
 
 		 309 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  32.49 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  30.9 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  31.92 
 
 		 317 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  26.8 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.68 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.78 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  26.64 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  27.47 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  28.37 
 
 		 334 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.89 
 
 		 337 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  27.01 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  26.59 
 
 		 320 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  27.82 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  26.24 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  26.71 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.48 
 
 		 341 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  42.31 
 
 		 346 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.7 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.96 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  27.74 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  27.65 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  27.24 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  24.91 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.76 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.34 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  26.87 
 
 		 564 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  26.57 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  28.68 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  25.45 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  32.52 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  27.27 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  27.86 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  41.74 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  41.74 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  41.74 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.36 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  27.54 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  26.59 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  37.4 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  26.57 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  25.87 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  25.39 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  26.77 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  26.32 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  27.74 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  28.27 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  28.27 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  29.02 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  29.02 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  29.02 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  33.63 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  26.64 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  27.73 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.62 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  25.17 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  25.29 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  30.97 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  30.97 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  30.97 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>