161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05807 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  100 
 
 
279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  95.7 
 
 
279 aa  564  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  75.27 
 
 
279 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  75.99 
 
 
279 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  74.19 
 
 
279 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  74.19 
 
 
279 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  74.19 
 
 
279 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  74.19 
 
 
279 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  73.48 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  73.48 
 
 
279 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  73.48 
 
 
279 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  73.48 
 
 
279 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  73.48 
 
 
279 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  73.12 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  73.48 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  72.04 
 
 
279 aa  434  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  71.68 
 
 
279 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  72.4 
 
 
279 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  70.97 
 
 
290 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  69.18 
 
 
279 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  67.99 
 
 
280 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  67.27 
 
 
279 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  55.43 
 
 
287 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  44.77 
 
 
289 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  34.45 
 
 
317 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  35.62 
 
 
348 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  32.81 
 
 
311 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.23 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  34.71 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  30.13 
 
 
312 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  32.88 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.7 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  32.76 
 
 
320 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.82 
 
 
318 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  30.82 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  33.66 
 
 
316 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  29.8 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 
330 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  27.3 
 
 
321 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.55 
 
 
337 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  27.4 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  29.89 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  27.05 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.26 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.3 
 
 
337 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  28.8 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  27.38 
 
 
321 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  27.51 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.9 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  27.14 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  27.14 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  27.21 
 
 
316 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  29.59 
 
 
367 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  27.86 
 
 
350 aa  86.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.04 
 
 
341 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 
343 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.43 
 
 
334 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 
343 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  28 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  25.66 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  28.62 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.41 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  34.3 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  26.83 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  27.09 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  27.13 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  28.41 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  27.11 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  26.28 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  26.28 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  27.53 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00880  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  27.44 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  26.83 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  27.21 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  39.68 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  26.26 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  25.58 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  26.3 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  29.73 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  29.73 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  25.29 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  29.73 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  26.24 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  29.55 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  25.45 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  30.3 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.45 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  26.39 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  26.69 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05542  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0412788  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  25.47 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  25.82 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  31.93 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>