160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2580 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
319 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  87.74 
 
 
319 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  82.91 
 
 
317 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  82.91 
 
 
317 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  82.91 
 
 
317 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 
337 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  33.67 
 
 
321 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  34.36 
 
 
323 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 
323 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  33.9 
 
 
323 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  34.35 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.33 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.25 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  32.29 
 
 
356 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  30.98 
 
 
334 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  28.7 
 
 
350 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  30.27 
 
 
343 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  34.15 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  30.35 
 
 
313 aa  119  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  32.29 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  31.17 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  30.7 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  32.97 
 
 
326 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 
340 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  30.51 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  31.02 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 
346 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  30.19 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  32.63 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  31.41 
 
 
321 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 
345 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  30.03 
 
 
330 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.78 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  32.98 
 
 
300 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  32.61 
 
 
320 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  30.49 
 
 
320 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.3 
 
 
328 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  30.95 
 
 
352 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.69 
 
 
321 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  32.67 
 
 
348 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  27.33 
 
 
318 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  31.37 
 
 
335 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  30.45 
 
 
321 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  31.46 
 
 
329 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 
349 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  30.71 
 
 
352 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.26 
 
 
318 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 
341 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 
343 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 
343 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.33 
 
 
347 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 
343 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  33.94 
 
 
347 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  28.53 
 
 
323 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  28.71 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  28.71 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  32.08 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.08 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  28.72 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  30.67 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  31.13 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  32.58 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2453  2OG-Fe(II) oxygenase  30.99 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0260647  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  28.44 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  30.2 
 
 
352 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  26.71 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  29.77 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  32.12 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  27.78 
 
 
316 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 
340 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  25.16 
 
 
320 aa  92.8  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  28.12 
 
 
349 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  29.81 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  31.16 
 
 
333 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  26.53 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.68 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  30.63 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  28.67 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.14 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  32.46 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  25.17 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  29.26 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  29.24 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  29.06 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  28 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  25.85 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  28.98 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  30.85 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>