158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0261 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 333 aa  691    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  64.13 
 
 		 330 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  60.94 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  61.19 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  59.19 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  54.97 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  48.84 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  42.23 
 
 		 564 aa  197  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  31.53 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02380  conserved hypothetical protein  41.33 
 
 		 236 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.042266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  34.14 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  29.68 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  31.35 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  28.62 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  29.71 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  29.97 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  27.35 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  30.57 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  29.71 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  28.34 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  34.13 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  29.75 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  28.3 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  29.24 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  30.42 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  31.14 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  31.14 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  31.14 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  27.18 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.7 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  27.88 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.77 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  33.1 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.7 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  27.74 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  26.92 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  27.54 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.13 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  27.56 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  27.13 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.76 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  28.71 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10026  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11160)  28.26 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558826  normal  0.219855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  31.16 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  34.26 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  25.88 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  28.52 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  28.52 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  29.49 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  31.62 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  30.27 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  30.27 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  30.27 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  28.25 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  28.48 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.13 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  28.53 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  27.22 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02655  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00800)  27.46 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263931 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  24.01 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  26.89 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00077  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12242)  29.72 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  28.16 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  31.2 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.56 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02390  conserved hypothetical protein  27.66 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  27.8 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  27.51 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2453  2OG-Fe(II) oxygenase  30.25 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0260647  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  28.4 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  26.24 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.05 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  26.09 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  24.05 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  27.38 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.39 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  28.42 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  28.06 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  26.98 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  26.95 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  26.48 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  26.71 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  26.48 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  26.48 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02840  hypothetical protein  24.9 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.646987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>