162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4357 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 327 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  41.14 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  41.46 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  41.64 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  40.38 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  40.19 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.44 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  41.14 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  40.78 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  36.97 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  40.78 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  36.81 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  39.94 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  44.82 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  40.19 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  40.19 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  40.19 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  41.27 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  36.89 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  41.46 
 
 		 329 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  38.36 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.2 
 
 		 337 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.08 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  39.81 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  37.62 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  35.83 
 
 		 345 aa  185  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  41.06 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  37.78 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  37.07 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  36.39 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  33.83 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  41.75 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  36.48 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  36.39 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  36.45 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  33.03 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  40.27 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  40.27 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  35 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  36.39 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.8 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  32.13 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  32.39 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  39.32 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  35.43 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  35 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  32.09 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.63 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  36.51 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  31.99 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  36.82 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  34.88 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  36.61 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  37.58 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  35.38 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  36.12 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  36.95 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  29.34 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  32.66 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  32.79 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  28.88 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  32.72 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  35.84 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  31.35 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  36.8 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.8 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  34.88 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  34.74 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  34.35 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  34.45 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  31.58 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  31.17 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  31.17 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.21 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  34.97 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  32.03 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  32.2 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  29.62 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  32.53 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45605  predicted protein  30.23 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147152  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  32.01 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  31.76 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  32.04 
 
 		 564 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  31.76 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  33.64 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  29.33 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>