163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1330 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
311 aa  630  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  66.45 
 
 
309 aa  408  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  60.25 
 
 
317 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  59.81 
 
 
348 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  53.05 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  56.03 
 
 
311 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  51.95 
 
 
312 aa  322  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  50.65 
 
 
311 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  48.41 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  45.73 
 
 
318 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  43.04 
 
 
316 aa  262  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  44.78 
 
 
320 aa  258  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  43.17 
 
 
318 aa  255  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  42.47 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  36.68 
 
 
340 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  34.86 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  35.65 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  36.01 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  34.81 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 
327 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  35.83 
 
 
321 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  34.18 
 
 
320 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  35.94 
 
 
313 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  32.91 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  33.54 
 
 
279 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.31 
 
 
321 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  33.86 
 
 
320 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  34.35 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  35 
 
 
279 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  34.01 
 
 
349 aa  152  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  36.03 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  32.81 
 
 
279 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  35.35 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  34 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  35.03 
 
 
290 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 
279 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 
279 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  36.16 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  36.42 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  34.38 
 
 
279 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 
279 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  33.54 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 
346 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 
346 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 
346 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  33.95 
 
 
351 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.67 
 
 
280 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  34.46 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.4 
 
 
337 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
338 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  32.82 
 
 
330 aa  136  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.66 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.75 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  31.89 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  34.22 
 
 
330 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 
340 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  36.27 
 
 
339 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  32.35 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  28.31 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  33.75 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.69 
 
 
329 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  31.02 
 
 
341 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 
335 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  32.3 
 
 
316 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  31.13 
 
 
323 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 
323 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  31.63 
 
 
343 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  31.97 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  34.14 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  31.08 
 
 
329 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  32.67 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  31.53 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.2 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  31.19 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  33.9 
 
 
326 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  29.43 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  32.58 
 
 
341 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
345 aa  115  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  32 
 
 
350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  31.92 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  31.86 
 
 
343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  31.86 
 
 
343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.92 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  31.86 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  30.65 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  35.46 
 
 
287 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  31.46 
 
 
367 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  30.9 
 
 
338 aa  112  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  30.94 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  30.94 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>