162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2508 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  100 
 
 		 347 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  74.64 
 
 		 348 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  61.81 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  62.1 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  62.35 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  64.44 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  64.44 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  61.19 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  61.49 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  60.67 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  60.66 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  61.09 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  62.16 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  57.1 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  53.82 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  59.37 
 
 		 326 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  52.91 
 
 		 334 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  52.91 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  52.6 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  45.45 
 
 		 330 aa  315  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  44.55 
 
 		 330 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  44.55 
 
 		 330 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  49.85 
 
 		 367 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  47.42 
 
 		 346 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  47.76 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  48.18 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  48.18 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  46.32 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  48.18 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  47.8 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  45.4 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  37.86 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  37.82 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  39.52 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  37.54 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  36.27 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  52.83 
 
 		 281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  31.04 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  37.04 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  35.2 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  34.01 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  36.01 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  37.76 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  37.58 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  37.06 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  37.15 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.01 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  35.42 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  31.67 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  36.11 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  35.42 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  32.63 
 
 		 318 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  36.49 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  36.49 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  36.49 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  32.12 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  34.27 
 
 		 351 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.84 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  32.55 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  28.71 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.51 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  32.65 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  32.32 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  35.04 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  32.75 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  33.56 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.46 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  31.48 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  28.72 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  32.97 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  29.32 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  31.95 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30.07 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  31.77 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  33.59 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  31.12 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  30.56 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  31.25 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  32.27 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  31.64 
 
 		 309 aa  99.4  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  30.69 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.33 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  29.97 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  29.27 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  32.27 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  30.21 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  28.81 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  35.37 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  29.45 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  30.35 
 
 		 378 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31624  predicted protein  30.2 
 
 		 381 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  hitchhiker  0.00491035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>