154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1673 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 
340 aa  703    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  33.23 
 
 
318 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  36.68 
 
 
311 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  34.11 
 
 
309 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  35.96 
 
 
348 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  31.19 
 
 
320 aa  169  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.7 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  32.29 
 
 
318 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  31.75 
 
 
316 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 
317 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 
318 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  31.69 
 
 
323 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  32.89 
 
 
312 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  31.13 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  34.32 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  28.83 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.88 
 
 
334 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  28.62 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.11 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.41 
 
 
337 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  28.98 
 
 
279 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  30.33 
 
 
279 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  31.03 
 
 
355 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  25.82 
 
 
350 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  28.15 
 
 
349 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  24.85 
 
 
335 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  27.67 
 
 
329 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 
279 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  27.59 
 
 
329 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  28.62 
 
 
279 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  29.97 
 
 
280 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  27.72 
 
 
279 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  29.41 
 
 
290 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 
352 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  28.05 
 
 
279 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  28.7 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  27.12 
 
 
279 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  27.6 
 
 
279 aa  99.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  28.39 
 
 
346 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  28.39 
 
 
346 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  28.05 
 
 
279 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  28.39 
 
 
346 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  28.05 
 
 
279 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  28.05 
 
 
279 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  27.07 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  27.72 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  28.28 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  26.8 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  26.8 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  29.47 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  27.66 
 
 
279 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  29.21 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  24.12 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  27.92 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  28.9 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  27.21 
 
 
279 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  27.56 
 
 
343 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  26.46 
 
 
317 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  28.45 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  28.8 
 
 
279 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  27.57 
 
 
279 aa  92.8  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  27.57 
 
 
279 aa  92.8  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  27.6 
 
 
350 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.45 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  27.83 
 
 
343 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  28.03 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  30.85 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  28.03 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  28.11 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  27.86 
 
 
323 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  27.95 
 
 
349 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  26.24 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  27.34 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.24 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  25.31 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 
341 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  25.36 
 
 
352 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  25.15 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  27.3 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  22.64 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  23.66 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  26.83 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  25.62 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  28.21 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  28.21 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  28.21 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  25.85 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  22.81 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.74 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.74 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  23.66 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>