162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3655 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 340 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  97.65 
 
 		 340 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  65.62 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  65.62 
 
 		 355 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  62.2 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  65.85 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  62.61 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  62.09 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  59.82 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  61.49 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  62.42 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  60.98 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  56.55 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  56.19 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  55.65 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  55.79 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  59.43 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  56.1 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  56.1 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  54.27 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  49.7 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  49.7 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  50 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  49.7 
 
 		 343 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  50.9 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  44.24 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  43.5 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  43.5 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  49.85 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  45.33 
 
 		 406 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  45.19 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  35.86 
 
 		 355 aa  198  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  40.14 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  36.86 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  34.56 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  36.81 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  40.2 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  41.32 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  40.27 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  41.32 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  31.42 
 
 		 373 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  52.8 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  36.14 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  35.83 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  35.83 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  35.83 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  36.14 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  36.49 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.59 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  33.73 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  36.59 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  37.76 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  36.52 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  34.47 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  34 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  37.32 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  34.58 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  34.42 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  33.23 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  34.35 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  34.24 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  33.55 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  32.88 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  34.48 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  32.59 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  35.53 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  34.26 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.39 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  34.08 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  35.71 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  30.13 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  32.58 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  32.66 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  27.12 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  29.79 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.28 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  32.12 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.8 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  35.02 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  32.87 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  30.51 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  30.28 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  34.66 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  31.47 
 
 		 233 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  29.62 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  31.21 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.3 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  28.96 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  30.07 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>