155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05960 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  100 
 
 
338 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  48.34 
 
 
330 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  48.84 
 
 
333 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  47.67 
 
 
328 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  46.23 
 
 
340 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  46.71 
 
 
327 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  46.23 
 
 
338 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02380  conserved hypothetical protein  38.95 
 
 
236 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.042266 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  36.86 
 
 
564 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  31.8 
 
 
312 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  31.99 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  31.67 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  31.45 
 
 
318 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  31.45 
 
 
311 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  29.05 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  32.85 
 
 
313 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  30.9 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  27.83 
 
 
320 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  28.87 
 
 
334 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 
300 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  27.13 
 
 
318 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  29.3 
 
 
320 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
345 aa  105  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  29.54 
 
 
321 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  29.3 
 
 
320 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  29.82 
 
 
341 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  28.23 
 
 
309 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  29.39 
 
 
348 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  28.79 
 
 
320 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 
332 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  29.28 
 
 
300 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  29.28 
 
 
300 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  27.57 
 
 
335 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  30.82 
 
 
318 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  29.59 
 
 
316 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  30.34 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.92 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.14 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  30.18 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  28 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  26.63 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  26.46 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.1 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  28.07 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  28.11 
 
 
326 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  28.01 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  28.34 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  31.16 
 
 
311 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  28.33 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  29.35 
 
 
349 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  27.63 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  23.91 
 
 
337 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  26.67 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  30.66 
 
 
339 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  28.25 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.91 
 
 
321 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00077  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12242)  27.91 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  26.12 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  26.07 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  26.56 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  26.07 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  26.07 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  25.75 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.68 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  24.69 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  27.81 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  26.71 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.68 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  26.62 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.81 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  28.48 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  28.42 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  27.13 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  28.42 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  27.87 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  27.45 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  27.45 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  27.45 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  27.15 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  25.32 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  27.08 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  26.07 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  25.68 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  26.26 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  27.39 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  22.95 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  26.12 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  24.92 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  26.26 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  25.45 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  26.2 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>