148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32280 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  100 
 
 		 373 aa  771    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  42.78 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  39.02 
 
 		 353 aa  225  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  36.26 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  35.34 
 
 		 355 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  35.34 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  32.52 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  32.43 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  33.42 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  36.29 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  32.98 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  31.3 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  33.43 
 
 		 335 aa  166  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  34.55 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  32.07 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  31.42 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.04 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  32.58 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  32.58 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  32.58 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  31.27 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.07 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  29.83 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  30.39 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.25 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.98 
 
 		 330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  32.4 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  30.87 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.19 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  30.58 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  30.11 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  29.65 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  32.15 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  29.89 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  28.34 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  30.79 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  29.58 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  28.24 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  28.2 
 
 		 320 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  26.62 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  26.89 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  29.84 
 
 		 233 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.26 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  27.41 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  27.41 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  27.41 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  26.52 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  27.46 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  30.07 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 		 345 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  25.47 
 
 		 337 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  27.56 
 
 		 327 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  25 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  26.95 
 
 		 330 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  27.56 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  29.47 
 
 		 316 aa  86.3  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  28.19 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  26.36 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  25.57 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  25.85 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  26.13 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  28.06 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  28.53 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  27.95 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  28.81 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  31.47 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  26.03 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  27.9 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  26.81 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  27.01 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  26.49 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.47 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  28.03 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  28.24 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  27.56 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  37.86 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  27.19 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  25.34 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  26.78 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  24.62 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  26.76 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  24.75 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  25.08 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  25.09 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  27.62 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  26.86 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  24.25 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  27.19 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  23.97 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  22.58 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  24.61 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  24.61 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  22.9 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  24.92 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  23.21 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>