13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3356 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3356  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2289  hypothetical protein  52.14 
 
 
298 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2578  hypothetical protein  49.82 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2835  hypothetical protein  47.04 
 
 
315 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0894  hypothetical protein  39.61 
 
 
295 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414459  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2572  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0294  hypothetical protein  37.96 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  30.61 
 
 
249 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  30.81 
 
 
249 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  30.3 
 
 
249 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  30.3 
 
 
249 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  30.3 
 
 
249 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47154  iron ion binding protein  27.31 
 
 
639 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>