15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1769 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  96.39 
 
 
249 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  93.57 
 
 
249 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  94.38 
 
 
249 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0894  hypothetical protein  42.05 
 
 
295 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414459  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0294  hypothetical protein  31.69 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2572  hypothetical protein  35.2 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2289  hypothetical protein  27.02 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3356  hypothetical protein  30.3 
 
 
306 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2835  hypothetical protein  27.5 
 
 
315 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47154  iron ion binding protein  36.02 
 
 
639 aa  95.1  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2578  hypothetical protein  28.14 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0750  hypothetical protein  27.62 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  21.79 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>