13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2289 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2289  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  616  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2578  hypothetical protein  55.79 
 
 
308 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2835  hypothetical protein  50.17 
 
 
315 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3356  hypothetical protein  51.71 
 
 
306 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2572  hypothetical protein  36.96 
 
 
288 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0894  hypothetical protein  39.6 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414459  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0294  hypothetical protein  34.38 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  29.82 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  27.02 
 
 
249 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  27.02 
 
 
249 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  27.02 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  26.61 
 
 
249 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47154  iron ion binding protein  26.72 
 
 
639 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>