13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2572 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2572  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  594  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2289  hypothetical protein  36.96 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2835  hypothetical protein  35.06 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2578  hypothetical protein  37.2 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0894  hypothetical protein  40.48 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414459  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  33.79 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  35.2 
 
 		 249 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  35.2 
 
 		 249 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  35.2 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0294  hypothetical protein  34.16 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1836  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47154  iron ion binding protein  30.13 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>