13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2578 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2578  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2289  hypothetical protein  55.79 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2835  hypothetical protein  51.04 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3356  hypothetical protein  49.82 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2572  hypothetical protein  37.2 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0894  hypothetical protein  40.59 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414459  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0294  hypothetical protein  35.15 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  27.97 
 
 		 249 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  28.14 
 
 		 249 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  28.14 
 
 		 249 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  28.14 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  28.14 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47154  iron ion binding protein  25.71 
 
 		 639 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>