15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1704 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6310  hypothetical protein  94.38 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1769  hypothetical protein  94.38 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5067  hypothetical protein  93.17 
 
 		 249 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1782  hypothetical protein  92.37 
 
 		 249 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0894  hypothetical protein  41.26 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414459  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0294  hypothetical protein  32.51 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.1836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2572  hypothetical protein  35.71 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2289  hypothetical protein  26.61 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3356  hypothetical protein  30.81 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2835  hypothetical protein  27.98 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47154  iron ion binding protein  35.48 
 
 		 639 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2578  hypothetical protein  28.14 
 
 		 308 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0750  hypothetical protein  27.62 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  24 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>