More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0434 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3241  aminotransferase class-III  87.03 
 
 		 455 aa  817    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0434  aminotransferase class-III  100 
 
 		 459 aa  952    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  38.58 
 
 		 475 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  38.04 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  37.8 
 
 		 475 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  38.44 
 
 		 467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  38.04 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  38.55 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  36.28 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  35.75 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  35.87 
 
 		 955 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.83 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.58 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.83 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  33.58 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  33.58 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.58 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  33.58 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.58 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.58 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  34.45 
 
 		 891 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.5 
 
 		 459 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.5 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  32.78 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.25 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.25 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.25 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.92 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  33.41 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  33.87 
 
 		 845 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  32.06 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.75 
 
 		 477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.25 
 
 		 457 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  33.66 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.97 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 463 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  31.92 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  31.28 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3098  aminotransferase  33.25 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  31.82 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  31.02 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  31.36 
 
 		 463 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  31.42 
 
 		 463 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  31.18 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  32.37 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.06 
 
 		 393 aa  199  9e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  34.26 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0851  aminotransferase, class III  30.04 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83306  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2968  aminotransferase class-III  29.82 
 
 		 471 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  33.9 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  31.85 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0799  aminotransferase, class III  30.04 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  33.42 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  33.42 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  33.42 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  31.68 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  33.59 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  33.92 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  30.87 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.26 
 
 		 402 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  34.34 
 
 		 392 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  31.64 
 
 		 402 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  32.59 
 
 		 389 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.46 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  32.59 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  31.95 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  31.95 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  34.16 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  32.01 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  31.51 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  33.08 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  30.61 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  31.91 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  32.34 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  30.61 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.22 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  33.01 
 
 		 441 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  31.92 
 
 		 390 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  29.98 
 
 		 440 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.94 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  31.99 
 
 		 396 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  29.07 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  29.07 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  31.83 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  32.67 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  31.18 
 
 		 442 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.92 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  32.1 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  31.12 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  31.98 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  31.82 
 
 		 384 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  31.58 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  31.53 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.44 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>