More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5127 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  100 
 
 		 453 aa  884    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  49.25 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3615  aminotransferase class-III  48.04 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.87 
 
 		 459 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.87 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.63 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.63 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.63 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.36 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  41.63 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  41.63 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.63 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  41.63 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.63 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.63 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.63 
 
 		 429 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  44.39 
 
 		 477 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  43.64 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.78 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.49 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  43.24 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  44.48 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  42.82 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.65 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  37.77 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.1 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  41.55 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  41.55 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  36.21 
 
 		 462 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  40.84 
 
 		 460 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  40.51 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  40.09 
 
 		 955 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  43.22 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  40.14 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  36.56 
 
 		 475 aa  246  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  43.72 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  42.2 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  42.31 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  40.1 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.42 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  38.74 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  39.1 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  36.08 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 		 390 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  37.81 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  39.25 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 		 414 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  40.79 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  41.47 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.74 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  35.36 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  38.76 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.72 
 
 		 375 aa  226  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  38.26 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.26 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  38.79 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  40.86 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  40.8 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  38.66 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  40.66 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2551  aminotransferase class-III  38.23 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  41.95 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.75 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.06 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.35 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  40.27 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  34.56 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.79 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0152211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.2 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  39.85 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  41.49 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0169  N2-acetyl-L-lysine aminotransferase / acetylornithine aminotransferase  41.14 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000199062  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  36.29 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  36.29 
 
 		 385 aa  220  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  41.53 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.9 
 
 		 413 aa  219  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  33.02 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  40 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.02 
 
 		 395 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  41.14 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  39.36 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  41.34 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  37.96 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  41.27 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.43 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.83 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  41.23 
 
 		 463 aa  216  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  45.9 
 
 		 845 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  37.89 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.86 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  38.85 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  32.51 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0767  aminotransferase class-III  35.9 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000633967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.39 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  37.74 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  35.43 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.82 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>