More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3568 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  67.97 
 
 		 477 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  84.88 
 
 		 463 aa  825    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  92.01 
 
 		 463 aa  882    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  92.87 
 
 		 463 aa  889    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  90.06 
 
 		 463 aa  875    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  100 
 
 		 463 aa  950    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  84.23 
 
 		 463 aa  816    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  88.52 
 
 		 453 aa  839    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  68.27 
 
 		 477 aa  667    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  60.13 
 
 		 462 aa  571  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  50.88 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  49.56 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  49.34 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  47.26 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3098  aminotransferase  44.1 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  43.36 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  38.69 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  41.63 
 
 		 460 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  37.85 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  39.47 
 
 		 463 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  40.53 
 
 		 467 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  38.69 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  36.81 
 
 		 475 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  34.48 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  40.58 
 
 		 845 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  40.72 
 
 		 955 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  37.4 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  36.3 
 
 		 891 aa  242  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.59 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  36.64 
 
 		 411 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  36.55 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.06 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.89 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.06 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  36.6 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  39.37 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  40.52 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  37.63 
 
 		 396 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  37.14 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  34.57 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  34.57 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.57 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  34.57 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  38.23 
 
 		 403 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.57 
 
 		 429 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  37.31 
 
 		 402 aa  223  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  36.88 
 
 		 386 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  35.98 
 
 		 397 aa  223  8e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  37.75 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.11 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.93 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.32 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.34 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.34 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.34 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  35.58 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.34 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  37.5 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  35.92 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  37.5 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  36.1 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.34 
 
 		 459 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  35.35 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  36.66 
 
 		 394 aa  220  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  36.66 
 
 		 394 aa  220  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  37.5 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.59 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  37.5 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.87 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  37.5 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  37.5 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.11 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.11 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.11 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  36.43 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  36.27 
 
 		 386 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.18 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  37.25 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  37 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  37.1 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  36.75 
 
 		 396 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.5 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  36.87 
 
 		 414 aa  217  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  36.1 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.87 
 
 		 477 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  36.1 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  36.36 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  35.9 
 
 		 386 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2968  aminotransferase class-III  33.49 
 
 		 471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 		 376 aa  213  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  35.14 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  36.43 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  37.53 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  38.97 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  35.75 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.03 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.73 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.2 
 
 		 400 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.87 
 
 		 399 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  37.02 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>