More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3615 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3615  aminotransferase class-III  100 
 
 		 426 aa  854    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  55.72 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  48.3 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.18 
 
 		 459 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  37.68 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  37.68 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.68 
 
 		 459 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.68 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  37.68 
 
 		 468 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.95 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.68 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.68 
 
 		 429 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 		 429 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.44 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  41.69 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.65 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.39 
 
 		 472 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  37.22 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  38.06 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.92 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.73 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  37.68 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  37.91 
 
 		 463 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  38.17 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  36.78 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  34.4 
 
 		 475 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  38.01 
 
 		 468 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  42.24 
 
 		 845 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.2 
 
 		 450 aa  223  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.11 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.16 
 
 		 390 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  38.27 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  39.52 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  32.83 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 		 402 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  34.88 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  32.98 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  32.98 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.34 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.69 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  35.7 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  37.2 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.2 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  35.19 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.15 
 
 		 416 aa  199  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  38.14 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  38.06 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  36.1 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.02 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  32.55 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  35.19 
 
 		 463 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0434  aminotransferase class-III  32.75 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  34.38 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  35.14 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.83 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  35.05 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  34.83 
 
 		 891 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  33.77 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  34.57 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  34.94 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.12 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.51 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  34.03 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.85 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  33.6 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.2 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  35.43 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.64 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.47 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.22 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  33.68 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  32.79 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  31.32 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  39.29 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  34.3 
 
 		 408 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  32.98 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.91 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.29 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  33.92 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1219  aminotransferase class-III  34.91 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0656786  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  30.42 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3241  aminotransferase class-III  35.55 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2551  aminotransferase class-III  34.22 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  34.38 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  32.43 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.75 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  31.32 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.69 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  32.98 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>