More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2885 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  68.63 
 
 		 463 aa  667    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  75.26 
 
 		 477 aa  751    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  70.59 
 
 		 463 aa  686    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  100 
 
 		 477 aa  972    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  68.83 
 
 		 463 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  69.28 
 
 		 463 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  67.97 
 
 		 463 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  70.15 
 
 		 463 aa  693    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  71.33 
 
 		 453 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  61.71 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  54.73 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  51.32 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  52.63 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  49.24 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3098  aminotransferase  44.52 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  41.57 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  42.27 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  39.11 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  41.67 
 
 		 463 aa  306  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  37.8 
 
 		 462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  39.37 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  38.84 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  37.39 
 
 		 475 aa  286  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  35.55 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  38.84 
 
 		 845 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  36.63 
 
 		 891 aa  253  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  36.89 
 
 		 955 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.56 
 
 		 459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.38 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.32 
 
 		 459 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  39.47 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.32 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.32 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.32 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  41.38 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.86 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  36.61 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  36.61 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  36.61 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.61 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.54 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.61 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.61 
 
 		 429 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.61 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.78 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  37.19 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  40.06 
 
 		 386 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  37.68 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  37.15 
 
 		 386 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  37.16 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  39.77 
 
 		 386 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  39.77 
 
 		 386 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 		 386 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  36.83 
 
 		 386 aa  226  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  35.97 
 
 		 396 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  35.97 
 
 		 396 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  35.73 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  35.97 
 
 		 396 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  38.01 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  35.49 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.68 
 
 		 472 aa  223  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  36.79 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  35.49 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  35.49 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  36.79 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  35.25 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  35.25 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.91 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  35.94 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  35.25 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.89 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.72 
 
 		 477 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.94 
 
 		 472 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.93 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  37.85 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  39.53 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  35.65 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  36.12 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.98 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  39.23 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  38.58 
 
 		 441 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  38.75 
 
 		 414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0434  aminotransferase class-III  33.66 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.49 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.49 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  38.81 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.9 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  36.42 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  32.51 
 
 		 398 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 		 392 aa  211  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  35.05 
 
 		 386 aa  210  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.27 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  35.87 
 
 		 390 aa  209  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  36.59 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  36.45 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  41.02 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  34.52 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>