More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7208 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  100 
 
 		 457 aa  921    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  65.42 
 
 		 457 aa  626  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  54.61 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  53.07 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  52.63 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  51.1 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  49.78 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  49.56 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  50.22 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  49.89 
 
 		 463 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  50.45 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  50.55 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  49.34 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  49.78 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3098  aminotransferase  44.55 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  41.36 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  44.32 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  39.19 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  38.5 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  43.95 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  41.87 
 
 		 845 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  41.06 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  40 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  36.76 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  35.08 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  39.05 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  35.94 
 
 		 955 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  38.16 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.78 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.24 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  36.73 
 
 		 429 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  36.73 
 
 		 459 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.73 
 
 		 429 aa  229  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.73 
 
 		 459 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.73 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  36.73 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.48 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.27 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.02 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.13 
 
 		 477 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  35.68 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.02 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.02 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.77 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  36.54 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  35.92 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.08 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.18 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.3 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.12 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  34.93 
 
 		 891 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  35.95 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.72 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0434  aminotransferase class-III  32.37 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  34.67 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  34.31 
 
 		 394 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  34.31 
 
 		 394 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.98 
 
 		 391 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  37.25 
 
 		 384 aa  210  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  36.98 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2968  aminotransferase class-III  32.86 
 
 		 471 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  33.75 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  34.05 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  34.51 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  35.2 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  35.2 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  34.02 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  35.1 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  36.5 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  35.46 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  34.72 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.04 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  35.54 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0851  aminotransferase, class III  32.38 
 
 		 484 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  37.41 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  38.25 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.38 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0799  aminotransferase, class III  32.14 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  35.73 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  35.05 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  37.69 
 
 		 395 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  34.14 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  34.14 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.78 
 
 		 428 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  34.22 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  35.95 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3241  aminotransferase class-III  32.2 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.46 
 
 		 465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.12 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.68 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.03 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  35.32 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  34.14 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02293  acetylornithine transaminase protein  35.82 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.39 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>