More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3098 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3098  aminotransferase  100 
 
 
449 aa  930    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2601  aminotransferase class-III  61.71 
 
 
451 aa  600  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  45.13 
 
 
463 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  44.55 
 
 
462 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  43.29 
 
 
463 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  45.1 
 
 
463 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  44.1 
 
 
463 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  43.89 
 
 
463 aa  360  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  42.53 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  43.67 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  45.05 
 
 
457 aa  352  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  44.52 
 
 
477 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  44.5 
 
 
477 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  40.37 
 
 
458 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  44.55 
 
 
457 aa  332  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  41.13 
 
 
469 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  40.05 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  36.04 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  39.57 
 
 
463 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  35.85 
 
 
475 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  38.65 
 
 
845 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  35.39 
 
 
475 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  38.61 
 
 
467 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  36.69 
 
 
468 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  34.44 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  35.53 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  35.17 
 
 
955 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.41 
 
 
457 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.41 
 
 
477 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.02 
 
 
472 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.39 
 
 
477 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  35.1 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 
429 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  33.18 
 
 
429 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 
429 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  33.18 
 
 
468 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  33.18 
 
 
459 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 
429 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.24 
 
 
459 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.38 
 
 
459 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.38 
 
 
459 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.38 
 
 
459 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.38 
 
 
459 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 
429 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.6 
 
 
472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.13 
 
 
459 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  32.39 
 
 
891 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.41 
 
 
459 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  37.65 
 
 
396 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  37.96 
 
 
396 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0434  aminotransferase class-III  33.17 
 
 
459 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  37.35 
 
 
396 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  33.18 
 
 
401 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  34.41 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  37.04 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  37.04 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  34.59 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  37.04 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  37.04 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  32.82 
 
 
396 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  34.33 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.95 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  33.91 
 
 
386 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0851  aminotransferase, class III  33.72 
 
 
484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83306  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  33.17 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.09 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2968  aminotransferase class-III  33.72 
 
 
471 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0799  aminotransferase, class III  33.49 
 
 
484 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 
391 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3241  aminotransferase class-III  32.93 
 
 
455 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 
386 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  33.26 
 
 
399 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  32.92 
 
 
396 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.5 
 
 
410 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.57 
 
 
395 aa  193  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  31.63 
 
 
410 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  33.58 
 
 
399 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.86 
 
 
398 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  32.84 
 
 
415 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  34.05 
 
 
395 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  31.58 
 
 
410 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  32.02 
 
 
394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  33.42 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  32.51 
 
 
417 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  31.17 
 
 
396 aa  190  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  32.64 
 
 
403 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  31.45 
 
 
414 aa  190  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  33.18 
 
 
398 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  32.25 
 
 
395 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  33.17 
 
 
396 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  33.18 
 
 
398 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  33.58 
 
 
420 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  32.59 
 
 
392 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  31.31 
 
 
402 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  32.41 
 
 
385 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  32.66 
 
 
385 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  35.53 
 
 
391 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>