More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1070 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  100 
 
 		 460 aa  949    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.87 
 
 		 457 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  37.62 
 
 		 411 aa  269  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  36.21 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.7 
 
 		 429 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.64 
 
 		 459 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.34 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  33.41 
 
 		 459 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.46 
 
 		 429 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  33.41 
 
 		 468 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.46 
 
 		 429 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.73 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  34.22 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.41 
 
 		 459 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.22 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  34.88 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.95 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.22 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  37.16 
 
 		 463 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  35.94 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  34.18 
 
 		 475 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.41 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1071  aminotransferase class-III  34.02 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  33.1 
 
 		 475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  34.23 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.75 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  35.33 
 
 		 403 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.72 
 
 		 393 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  34.07 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  34.13 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  35.94 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  34.85 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.55 
 
 		 395 aa  219  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  35.64 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.77 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  34.49 
 
 		 376 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  34.31 
 
 		 395 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  33.11 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  35.85 
 
 		 458 aa  216  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.45 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  34.96 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  34.07 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  36.03 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.24 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.75 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0198  aminotransferase  30.43 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0207  aminotransferase  30.43 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.2 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.46 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  35.16 
 
 		 395 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  32.88 
 
 		 398 aa  213  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0187  aminotransferase  30.43 
 
 		 425 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  34.34 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5565  aminotransferase class-III  30.43 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  34.67 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  33.58 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.2 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  34.99 
 
 		 401 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1243  aminotransferase class-III  29.92 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000210523  hitchhiker  0.000012077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  32.23 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0659  aminotransferase class-III  32.44 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  33.96 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.58 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.52 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  35.26 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.71 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.01 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  31.79 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.97 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.24 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2247  putative aminotransferase  29.85 
 
 		 410 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  33.15 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.32 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  29.4 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  34.76 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  34.47 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  35.51 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  30.88 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.43 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  33.98 
 
 		 400 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  35.92 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0221  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.34 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  32.62 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  34.58 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  31.61 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.86 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  35.14 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  34.51 
 
 		 403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.51 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  32.88 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  33.95 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.98 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  34.59 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>