109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_10461 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  186  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  74.44 
 
 
91 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  70 
 
 
91 aa  139  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  57.3 
 
 
91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  57.47 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  52.75 
 
 
91 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.53 
 
 
97 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.53 
 
 
97 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  52.22 
 
 
90 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  50.56 
 
 
90 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  45.56 
 
 
91 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  48.89 
 
 
92 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  52.22 
 
 
91 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  49.45 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  45.45 
 
 
91 aa  87  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46.07 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  52.11 
 
 
71 aa  84.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  52.11 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  42.22 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.83 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.07 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.13 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.66 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.42 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.06 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  40.91 
 
 
114 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.91 
 
 
114 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.91 
 
 
114 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.91 
 
 
114 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.36 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.36 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  40.91 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  40.91 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.53 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  35.53 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.75 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  37.5 
 
 
609 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.32 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.32 
 
 
162 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  35.94 
 
 
114 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  39.68 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  39.68 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  40.32 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.71 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.67 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  35.94 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.06 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  32.81 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.06 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.17 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  34.18 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40 
 
 
123 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  35.94 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.1 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.76 
 
 
121 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.5 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.06 
 
 
113 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  32.31 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.72 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  33.87 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  32.81 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.94 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.46 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  30.21 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.83 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 
149 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.69 
 
 
114 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.75 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  35.94 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.38 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  34.38 
 
 
124 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  30.3 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.29 
 
 
116 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
127 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.38 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  34.38 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.81 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.81 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  35.94 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.94 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>