101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0959 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  100 
 
 
91 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  83.52 
 
 
91 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  70 
 
 
90 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  59.55 
 
 
91 aa  117  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  62.82 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  45.56 
 
 
91 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.53 
 
 
97 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  60.53 
 
 
97 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  51.65 
 
 
91 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  43.96 
 
 
91 aa  103  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  43.96 
 
 
91 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  46.67 
 
 
91 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  49.44 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  49.44 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.94 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.94 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  42.22 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  53.52 
 
 
71 aa  87.4  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.82 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  46.25 
 
 
87 aa  84  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.94 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.21 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  42.65 
 
 
609 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.65 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.62 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.06 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.1 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  40.62 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  39.06 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.39 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.39 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  39.06 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  39.39 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.39 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.88 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  39.06 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  37.88 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  37.1 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.88 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.06 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.1 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.94 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.1 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  35.38 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.81 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.1 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.92 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  32.81 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  30.77 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.58 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.31 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.31 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.1 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.81 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.35 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.26 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  31.82 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.31 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.65 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.69 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.84 
 
 
124 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 
170 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
127 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.69 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.69 
 
 
123 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.38 
 
 
222 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  28.12 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  33.87 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.18 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.87 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.84 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>