78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5081 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 151 aa  314  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  88.74 
 
 		 151 aa  285  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  85.43 
 
 		 151 aa  278  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.15 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.49 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  53.1 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.73 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.37 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  44.53 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.41 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.19 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  41.94 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  41.94 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  41.94 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  42.19 
 
 		 609 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  41.6 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  41.6 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.5 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.54 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  36.76 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.35 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  30.1 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  37.1 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.21 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  35.96 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  35.29 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.29 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.29 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  32.35 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.12 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.12 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  37.1 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  33.82 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  35.48 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  35.48 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.94 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  32.94 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.94 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  32.35 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.76 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.76 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.29 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.87 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.48 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.59 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.85 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.81 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.16 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  31.76 
 
 		 114 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  27.45 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  29.41 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.94 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3370  hypothetical protein  28.21 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.587978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.97 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  31.76 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  32.35 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.29 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  31.76 
 
 		 114 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.47 
 
 		 127 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3472  hypothetical protein  28.21 
 
 		 124 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3298  putative cytoplasmic protein  28.21 
 
 		 124 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.571522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3303  putative cytoplasmic protein  28.21 
 
 		 124 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3377  putative cytoplasmic protein  28.21 
 
 		 124 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.627866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.81 
 
 		 252 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  26.97 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.89 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  32 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.83 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  30.91 
 
 		 241 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>