87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3096 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
120 aa  234  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  62.5 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  53.7 
 
 
131 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0498  protein of unknown function DUF861, cupin_3  47.71 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.89 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0992  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0974  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5899  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.9 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.36 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.64 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.56 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.21 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.17 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.13 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.83 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.04 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.63 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.58 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.68 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  33.68 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.68 
 
 
114 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.48 
 
 
114 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  28.43 
 
 
237 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  34.48 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.48 
 
 
114 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.74 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.66 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.02 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  33.94 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.55 
 
 
244 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  29.67 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.68 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  34.86 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  34.48 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.68 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.96 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  31.25 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  28.85 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.48 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  29.29 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  29.29 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.18 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.81 
 
 
244 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.64 
 
 
244 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.3 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.02 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  35.16 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  26.47 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  33.71 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.11 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.96 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  27.88 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  30.11 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  34.02 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  44.19 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  36.73 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.64 
 
 
260 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  44.19 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  28.85 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.64 
 
 
260 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  35.38 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.97 
 
 
121 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.41 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  36.99 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.18 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.63 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.87 
 
 
227 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  24.04 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  27.08 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  27.08 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.16 
 
 
236 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  38.46 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  29.29 
 
 
609 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.89 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  28.89 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>