87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3784 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
222 aa  461  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  51.98 
 
 
227 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  53.54 
 
 
127 aa  138  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  45.33 
 
 
114 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  46.38 
 
 
114 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.58 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.58 
 
 
113 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.13 
 
 
113 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  39.13 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.4 
 
 
120 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  37.18 
 
 
114 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.46 
 
 
114 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.96 
 
 
115 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  33.94 
 
 
114 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.94 
 
 
119 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  31.58 
 
 
114 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  34.25 
 
 
115 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.11 
 
 
117 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  30.09 
 
 
114 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.56 
 
 
114 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.43 
 
 
127 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.19 
 
 
128 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  30.09 
 
 
114 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.27 
 
 
116 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.46 
 
 
114 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.46 
 
 
114 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  31.46 
 
 
114 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.13 
 
 
120 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.13 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 
128 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.26 
 
 
113 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.14 
 
 
123 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  25.93 
 
 
114 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.46 
 
 
114 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.68 
 
 
119 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.46 
 
 
114 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  32.88 
 
 
126 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  31.08 
 
 
121 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.11 
 
 
117 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.34 
 
 
114 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.06 
 
 
116 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.68 
 
 
115 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.34 
 
 
114 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  30.34 
 
 
114 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  34.72 
 
 
126 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.34 
 
 
120 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.84 
 
 
117 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.77 
 
 
120 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.68 
 
 
121 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.34 
 
 
114 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.34 
 
 
114 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.68 
 
 
121 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.77 
 
 
123 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.67 
 
 
114 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.57 
 
 
126 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  27.35 
 
 
124 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.38 
 
 
121 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.78 
 
 
121 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  29.33 
 
 
149 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  33.78 
 
 
121 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.78 
 
 
121 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  28.38 
 
 
122 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.78 
 
 
121 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.78 
 
 
121 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.76 
 
 
113 aa  45.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.78 
 
 
119 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  32.43 
 
 
120 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  30.67 
 
 
128 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  31.08 
 
 
120 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  28.38 
 
 
121 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.86 
 
 
121 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.6 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.06 
 
 
91 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.57 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  30.68 
 
 
131 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.51 
 
 
120 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  31.08 
 
 
120 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  31.58 
 
 
114 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.3 
 
 
144 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.3 
 
 
149 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  29.33 
 
 
119 aa  42  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  34.38 
 
 
91 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  29.33 
 
 
120 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  24.35 
 
 
119 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  24.09 
 
 
170 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  28.38 
 
 
119 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>