77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1483 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  88.6 
 
 		 114 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  80.7 
 
 		 114 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  71.93 
 
 		 114 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  41.74 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.35 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.47 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  44.33 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  36.52 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  38.6 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  50.72 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.09 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.91 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.91 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3784  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.58 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  39.39 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  39.39 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.84 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.39 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.39 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.39 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.39 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  39.39 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.39 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  39.39 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  42.5 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.91 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.9 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.71 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.71 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.88 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.16 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.76 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.27 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  35.82 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  32.81 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  32.81 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  33.8 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  34.78 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.95 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.99 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  35.21 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.57 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.88 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.88 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.81 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.62 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.91 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.82 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  31.25 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  35.82 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.43 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.56 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  30.43 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.58 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  36.92 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34670  cupin superfamily protein  25.45 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180426  normal  0.0825937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  31.88 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.88 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.53 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2942  hypothetical protein  25.45 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>