88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4332 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 		 162 aa  334  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  93.25 
 
 		 163 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  67.65 
 
 		 163 aa  206  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  55.56 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5486  protein of unknown function DUF861 cupin_3  47.62 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1806  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.26 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0990  hypothetical protein  45.83 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.154522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1093  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.17 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5081  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.41 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.79 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.79 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  39.84 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  39.69 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  39.69 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  39.69 
 
 		 138 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  43.24 
 
 		 609 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3632  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.04 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816275  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.27 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.37 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.94 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  41.94 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  35.96 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.71 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  40.32 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  29.73 
 
 		 124 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.83 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.73 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.73 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  37.1 
 
 		 92 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  40.98 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  32.53 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  30.65 
 
 		 91 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  30.65 
 
 		 91 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  38.71 
 
 		 91 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  29.47 
 
 		 237 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.66 
 
 		 127 aa  47.4  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.62 
 
 		 113 aa  47.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  35.48 
 
 		 71 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.42 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.78 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  29.47 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  32.97 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.48 
 
 		 89 aa  45.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  37.1 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  25.89 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  36.07 
 
 		 91 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  27.42 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.32 
 
 		 252 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.97 
 
 		 117 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.55 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1940  protein of the cupin superfamily-like protein  29.9 
 
 		 131 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  31.46 
 
 		 126 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  29.35 
 
 		 123 aa  43.9  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.31 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  28.42 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.98 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  32.73 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.59 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.03 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  33.87 
 
 		 90 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  28.92 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.6 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.9 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 		 88 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.59 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.78 
 
 		 120 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0498  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.19 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  28.92 
 
 		 114 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.59 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  30.77 
 
 		 118 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  25.53 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  24.77 
 
 		 121 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  24.77 
 
 		 121 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.59 
 
 		 114 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.53 
 
 		 113 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.48 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  24.77 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.17 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  30.53 
 
 		 114 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>